Скопируйте этот код и вставьте вместо того где у вас выводится кнопка "Ответить".

========================================

<?php printf('<span style="cursor:pointer; text-decoration: underline;
color: blue;" class="comment-reply-link" onclick="return addComment.moveForm(\'comment-%s\', \'%s\', \'respond\', \'%s\')">Ответить</span>',$comment->comment_ID,$comment->comment_ID,$comment->comment_post_ID); ?>

========================================

Этот код нужно вставить в function.php если вы решили дать дублям 404 ошибку.
Чтобы решить что лучше редирект или 404 ошибка, то посмотрите видео из раздела
"Заключение" - Полезные советы. Изначально рекомендую поставить редирект.

========================================

add_filter('template_redirect','Redirect404');
function Redirect404()
{
 $p=strpos($_SERVER['REQUEST_URI'],'/'.'attachment'.'/');
 if($p!==FALSE) {
 
  @header("HTTP/1.0 404 Not Found");
  die();
 }

 if ( isset( $_GET['replytocom'] ) ) {

  @header("HTTP/1.0 404 Not Found");
  die();
 }

 if ( isset( $_GET['attachment_id'] ) ) {

  @header("HTTP/1.0 404 Not Found");
  die();
 }
 }

========================================

Закрыть только replytocom:

========================================

add_filter('template_redirect','Redirect404');
function Redirect404()
{
 if ( isset( $_GET['replytocom'] ) ) {

  @header("HTTP/1.0 404 Not Found");
  die();
 }
}

========================================

Чтобы дополнительно дать 404 ошибку какой-то странице, то добавьте в function.php код:

if ( isset( $_GET['здесь текст url'] ) ) {

  @header("HTTP/1.0 404 Not Found");
  die();
 }